根據特許經營資源的特點與種類，特許人應從以下幾個方面保護特許經營資源:
(一)對特許經營資源的專有權利進行法律保護
對于已有專有權利的特許經營資源，通常包括專利注冊商標、著作權等法定知識產權，這些專有權利可能因被撤銷、被宣告無效、權利期滿、權利人放棄等原因而失效。因此，特許人應當時刻關注影響專有權利的各種因素，并采取有效得當的措施排除威脅專有權利的各種風險。
對于尚未取得專有權利的特許經營資源，通常包括未注冊登記的商標、未申請專利的專有技術、未經國家有關部門登記備案的商業秘密、未經工商登記的企業商號、未登記備案的計算機軟件等，特許人對這些經營資源沒有專有權利，很容易被他人仿冒或獲取，甚至被他人搶先注冊登記。因此，許人應及時對商標進行注冊登記，對專有技術申請專利、對商業秘密進行備案登記，對企業商號進行工商登記，對計算機軟件進行備案登記，這樣才能賦于經營資源專有權。
(二)對侵犯特許經營資源的行為進行維權
特許經營資源絕大部分屬于知識產權，尤其以注冊商標、專利權、著作權、商號、商業秘密最為普遍。而知識產權的無形性特點，決定了特許經營資源容易遭受外部侵權，其價值評估也易受外部因素影響，很可能因侵權、負面公眾事件、標識變更、經營秘密公開等原因而導致價值降低。因此，特許人應及時進行危機公關和維權，以確保特許經營資源價值不貶損。
(三)對特許經營資源進行價值提升
特許經營資源的吸引力決定了特許經營項目的運營前景和盈利狀況，特許人為確保特許經營資源增值保值，應當持續地提升特許經營資源的含金量。例如，特許人對商標與商號進行宣傳和推廣以提高知名度與美譽度，對經營訣竅進行優化以改進工作效率和經營指標，對商業秘密進行加密保護以防泄露，對專利技術進行創新以保持技術優勢，對商業模式進行優化調整以提升市場競爭力。
